Um novo laboratório de Sequenciamento de Nova Geração!

Science, Technology

Nossa equipe de Diagnóstico Molecular está agora equipada com um novo laboratório de Sequenciamento de Nova Geração (do inglês, Next Generation Sequencing ou apenas NGS) e queremos compartilhar mais sobre ele. Para isso, fizemos uma sessão de P&R com Soledad Ulloa, nossa Chefe de Diagnóstico Molecular.

Confira as respostas abaixo:

1. O que é um laboratório NGS? O que esta tecnologia nos permite?

Um laboratório NGS, que significa Next Generation Sequencing, é onde amostras de ácidos nucléicos (DNA ou RNA) são processadas para sequenciamento paralelo maciço (muitas amostras simultaneamente) e de alto rendimento (obtenção de uma grande quantidade de dados para análise). 

Através do NGS, podemos decifrar a informação genética de um organismo para conhecer as características de seu genoma, tais como: comprimento do genoma, fatores de virulência, genes de resistência antimicrobiana, presença de plasmídeos, clonagem, presença de profágenos, entre outros. Estas informações permitem à PhageLab® desenvolver produtos especificamente direcionados contra o agente infeccioso a ser combatido, e recomendar medidas de contenção e melhoria contínua aos clientes.

2. Como isso torna nosso processo mais rápido e melhor?

Na PhageLab®, a área de Diagnóstico Molecular possui equipamentos de larga escala de biologia molecular e a implementação deste novo laboratório nos permite fortalecer nossas capacidades, pois agora temos um espaço dedicado e equipamento exclusivo para trabalhar com as amostras que são sequenciadas. Isto nos permite ser o laboratório de diagnóstico molecular mais rápido da indústria pecuária, com um foco especial na Saúde Animal.

3. O que é exatamente a tecnologia Illumina?

A tecnologia Illumina torna possível decifrar informações genéticas através de um sequenciamento de alta qualidade e profundidade de pequenos fragmentos de DNA. A taxa de erro desta tecnologia é muito baixa, portanto, a sequência obtida é altamente confiável. Entretanto, os pequenos fragmentos tornam difícil manipular a grande quantidade de dados obtidos para cada amostra: é como tentar montar um quebra-cabeça de peças muito pequenas sem ter a imagem final a que queremos chegar (para montagens de novo).  Para montar estes quebra-cabeças, nossa equipe de bioinformática desenvolveu algoritmos específicos para estruturar as informações e fornecer um resultado altamente confiável.

4. O que Nanopore faz?

A tecnologia Nanopore também permite um sequenciamento profundo, mas com uma qualidade inferior, o que torna o resultado menos confiável. A vantagem desta tecnologia é o comprimento dos fragmentos sequenciados, que são pelo menos 150 vezes maiores do que os sequenciados pelo Illumina, com os protocolos que estamos usando na PhageLab®. Isto facilita muito a manipulação dos dados porque, seguindo a analogia acima, se tivermos um quebra-cabeça feito de duas peças gigantes, não precisamos da imagem de referência para poder montá-lo facilmente.  

 A grande vantagem de ter ambas as tecnologias implementadas no Diagnóstico Molecular é que agora podemos complementar informações e aproveitar os benefícios de cada uma: a facilidade de montagem de genomas usando Nanopore e a alta qualidade das sequências obtidas pela Illumina.

 

PhageLab® é uma marca registrada no Chile, Europa, México, Peru e Reino Unido, e como marca nominativa no Chile e Brasil.

Artigo Seguinte
Menu